インストール済み一覧 まとめ


  • netCDF

 YaSTでは4.0がデフォルト。が、ifortでコンパイルをかけたかったので、GMTインストールと一緒にマニュアルで入れ直す。

 矢羽根パッチ入りのsrcをありがたく頂きました。ありがとうございます。
 http://www.rain.hyarc.nagoya-u.ac.jp/~kato/work/GMT/index.html

tar xzvf netcdf.tar.gz #これはGMT本家から落としたもので、4.0.1でした。
cd netcdf-4.0.1
export FC=ifort
export CPPFLAGS="-DNDEBUG -DpgiFortran"
./configure --prefix=/usr/local  #インストール先指定
# 本当は--enable-sharedも付けて共有ライブラリも作成したかったが、エラー中断するので断念。(libnetcdff90.aにて'a local symbol'は使われないものにつき-fPICを使えと言われ…)
make check
make install

tar jxvf GMT4.4.0_src.tar.bz2
tar jxvf GMT4.4.0_share.tar.bz2
tar jxvf GMT4.4.0_doc.tar.bz2
cd GMT4.0
patch -p1 < gmt4.4.0_barb_src.patch20090224
./configure --prefix=/opt/GMT4.4.0
make
make install-gmt
make install-data
make install-man
make install-doc

  • 一覧表
サービス名 バージョン 場所
tomcat6 6.0.18 /etc/tomcat6
apache2 2.2.10 /etc/apache2
PHP 5.2.9 このバージョンがapache,tomcat連携で曲者か?(5.2.6の別マシンは動く)
JDK 1.6.0  
fastcgi 2.4.2  
MySQL 5.1.34 /var/lib/mysql
Ruby 1.8.7  
Ruby on Rails 2.2.2  
ifort 11.0.083 /opt/intel
icc 11.0.083 /opt/intel
GMT 4.4.0 /opt/GMT4.4.0
GrADS 2.0.a5  
R 2.8.1  
netCDF 4.0.1 /usr/local/bin
HDF5 あとで  
HDF4.2r3 あとで  
TSDIS toolkit 6.44 あとで  
GRASS あとで